π Alignment Tool
Sequence Similarity
μ΅λ 5κ°μ DNA/RNA μμ΄μ λΉκ΅νμ¬ μ μ¬λλ₯Ό μΈ‘μ ν©λλ€. κ° μμ΄μ μ΅λ 5,000μκΉμ§ μ λ ₯ κ°λ₯ν©λλ€.
π μμ΄ μ λ ₯ (μ΅μ 2κ°, μ΅λ 5κ°)
π λΆμ κ²°κ³Ό
π Pairwise Alignments
π‘ Sequence Similarityλ?
Overall Similarity: μ 체 μ μ¬λ (μ λ ¬λ μμμ identity Γ coverage)
Local Identity: μ λ ¬λ λΆλΆμμμ μ€μ μΌμΉμ¨ (single bp μ°¨μ΄λ κ°μ§)
Coverage: λ μμ΄μ΄ κ²ΉμΉλ λΉμ¨
μκ³ λ¦¬μ¦: Sliding window local alignment (λͺ¨λ μμΉμμ μ΅μ μ λ ¬ νμ)
νΉμ§: μμΉ shift, partial overlap, single nucleotide variation λͺ¨λ μ νν κ°μ§
μ λ ₯: μΌλ° μμ΄ λλ FASTA νμ (곡백/μ«μ μλ μ κ±°)
Local Identity: μ λ ¬λ λΆλΆμμμ μ€μ μΌμΉμ¨ (single bp μ°¨μ΄λ κ°μ§)
Coverage: λ μμ΄μ΄ κ²ΉμΉλ λΉμ¨
μκ³ λ¦¬μ¦: Sliding window local alignment (λͺ¨λ μμΉμμ μ΅μ μ λ ¬ νμ)
νΉμ§: μμΉ shift, partial overlap, single nucleotide variation λͺ¨λ μ νν κ°μ§
μ λ ₯: μΌλ° μμ΄ λλ FASTA νμ (곡백/μ«μ μλ μ κ±°)